为悯恻，自古功臣受茅土之封，飨血食之祭，先代所美，朕不敢忘。”
朱载坖随后写到：“朕查考古制，太祖葬功臣于钟山之阴，永葆血食，朕深以为然。故赠马芳武平王、太师兼太子太师、左柱国、特进光禄大夫、中军都督府左都督，予谥武宁，赐葬大峪山昭陵之侧，配享太庙，朕其与王永享血食矣！”
朱载坖亲笔撰写诏书，不仅追赠马芳武平王，陪葬昭陵，而且还给了马芳武将的最高谥号，武宁，对于马芳来说，可谓是哀荣备至了，朱载坖直接将诏书下达给内阁，要求执行，对于朱载坖的诏书，辅臣们本想再次劝说朱载坖的，但是朱载坖根本不予接受，直接拒绝接见辅臣们。
同时还遣太子朱翊釴亲往迎灵，工部尚书严世蕃为马芳在大峪山慎择吉壤，迅速营建陵墓，朱载坖随后还下达诏书，马芳长子马栋袭爵潞国公，次子马林任京卫副都指挥使带俸，等到守制结束之后再上任，同时从内承运库拨银治丧。
遣宣府镇总兵、英国公世子张元功领兵护送，赐祭七坛，同时朱载坖还下达命令，令马芳入祀贤良祠，对于马芳进行高规格的祭祀活动。
同时命令戚继光带领大军回朝受赏，对于大明来说这次是空前的胜利，当然少不了大规模的赏赐，对于参战的士卒们还有立功的各级将校士卒，都要予以赏赐，同时朱载坖还命令李成梁在河套加紧修建边堡，将整个河套的边防建立起来，为大明在之后的开发河套提供方便。
同时首辅李春芳请辞，这也是之前朱载坖就答应李春芳的，等到张居正守制结束，李春芳就可以致仕了，朱载坖在和李春芳三辞三让之后，批准了李春芳的辞职，和李春芳一道致仕的还有文华殿大学士殷士儋，朱载坖随后下诏起复守制结束的原中极殿大学士张居正为首辅。
太子妃谭氏也生下了太子朱翊釴的嫡长子，朱载坖为之取名朱常瀛，同时李贵妃和陈贵妃也为朱载坖诞育两位公主，而在李春芳致仕之前的最后一个请求就是为皇次子朱翊钧封王，在内阁和礼部的再三请求之下，朱载坖同时册封皇次子朱翊钧为端王，同时为此择立王妃等事，至于之国的相关程序，朱载坖并没有予以启动，朱载坖对于直接分封藩王还是有所忌惮的，朱载坖本人一直就对于藩王制度不甚感冒，所以一直在思考对于藩王制度的改革。
所以对于朱翊钧的之国一事，朱载坖才会一直有所迟疑。还是在李春芳的再三请求之下才册立了端王的，同时就是对于战事的收尾，不仅仅是赏赐有功人员，还有对新收复的卫所予以守卫，重新建立起大明的外边防线