“如果以李贤为功臣，天下人人学他，道德岂不败坏？”
“臣以为李贤为贤臣或可，功臣大可不必！”
有这么多人反对，朱由检也懒得亲自下场批判、和群臣就方孝孺的事情争起来，所以他从善如流道：
“紫阁功臣，确实应该为天下表率。”
“治政或有权变，却不能心存恶意、故意道德败坏。”
把李贤这个人选否决，并且打上了道德败坏的标签。
这让群臣对推荐的人选更慎重了一点，免得好处没捞到，反而被人批判。
内阁首辅黄立极，见到这一幕后，终于代表内阁，又推出一个人选：
“商文毅公三元及第，又辅政宪宗治政，中兴大明。”
“人皆说：我朝贤佐，商公第一。”
“商文毅公，当为紫阁功臣！”
内阁大学士不管怎么说，都被人视作宰相。在于谦这个兵部尚书被排在功臣第一后，他们需要推出一个人选，作为大学士的表率。
群臣虽然觉得商辂的功业相比于谦差得远，有点撑不起来紫阁功臣的称号。但是除了他之外，那一段时间没有更合适的人。
再加上商辂三元及第的事情，让所有经历过科场的文官服气。他们对这个人选，至少不会反对。
朱由检看着群臣的态度，虽然觉得商辂的功业差了点，但是列为紫阁功臣，勉强还算可以。而且因为商辂曾三元及第，民间传扬起来，不会觉得商辂撑不起，不会觉得紫阁功臣是笑话。所以他赞同道：
“商文毅公德业兼有，当为内阁大学士表率。”
“当为紫阁功臣第二位！”
确定于谦之后，商辂排在第二。
然后又对商辂，封赠爵位神位：
“追赠商辂为淳安伯，后裔世袭指挥佥事。”
“朕会向太祖成祖提议，封商辂为严州府城隍。”
只是追赠伯爵，神位也只是府城隍。相比于谦来说，可谓差了许多。
然而群臣想到商辂的功业，大多对此表示满意。
因为很多人猜测，商辂按功绩有可能连爵位都赠不到。皇帝这个封赏，已经称得上大方。
很多内阁大学士和未来大学士，开始以商辂为榜样，争取能有商辂的德业。
商辂之后，群臣还想推荐文臣，朱由检看不下去，说道：
“正统、景泰年间，多有文臣武将立功，甚至被封爵者。”
“他们也应该为紫阁功臣，不能视而不见。”
让兵部尚书袁可立，提出功臣人选。