为刑部尚书，他就如其所愿。
南京刑部右侍郎杜士全，因为身体不好请求回籍调理。朱由检应其所请，任命群臣廷推的冯英为南京刑部右侍郎。
最后的南京工部，尚书张凤翔被调任北京刑部左侍郎，右侍郎张维枢被弹劾冠带闲住。
这次群臣廷推出靳于中担任南京工部尚书，何乔远担任南京工部右侍郎。
南京都察院职务，由江南巡抚、安徽巡抚、提督操江等官员兼任。
南京大理院暂时只设协理院事，被群臣廷推朱世守担任。此人同样是东林党人，曾任广西巡抚、刑部右侍郎。
最后的南京理藩院协理院事，朱由检任命彰武伯杨崇猷担任。这是他追封功臣后，冒出来想做事的勋贵之一。朱由检先安排个没多大实权的职位，看看他的能力。
南京朝廷大臣任命之后，朱由检最后任命的是地方官员。
按照之前制定的督抚任期制，漕运总督兼凤阳巡抚、天津巡抚、四川巡抚、广西巡抚、南赣巡抚、郧阳抚治、陕西巡抚、甘肃巡抚、湖南巡抚的任期，从崇祯二年开始计算。
在任期结束之前，这些督抚都写了施政纲要。朱由检因为他们任职未久，大多予以留任。
需要更换的，唯有被调任南京刑部尚书的漕运总督兼凤阳巡抚郑三俊，朱由检在群臣推举下，任命原工部尚书总理河道朱光祚担任此职。
这又是一位东林党人，朱由检只能感慨，很多有能力的人才，都被纳入了东林党。
地方督抚之中，现在有很多是起复的东林党人。
这也是朱由检这次在朝堂上起用了很多翰林出身官员，并且在多番斟酌后，仍旧任命韩爌为首辅的原因——
方便把政策推行到地方去。
他心里面期望的，是韩爌能够约束东林党，不要像天启年间那样党同伐异。
否则他就不得不痛下狠手，彻底把东林党从朝堂上赶出去。
为此，朱由检在朝会结束后，特意留下了韩爌。
群臣对此也不感到意外，因为今日最荣耀的，还是韩爌被宣麻拜相。
这是开国以来，文臣所受到的最大礼遇之一。
韩爌心里面仍旧残留着激动，期望能做出一番事业，不负皇帝礼遇。
西苑之中，朱由检向韩爌道：
“卿是嘉靖四十五年出生的吧？”
“按虚岁是六十四岁？”
韩爌恭敬回道：
“是！”
“臣在嘉靖四十五年出生，第二年就是隆庆元年。”
朱由检闻言感叹道