元朝是中国的正统朝代吗？
这在大明并没有一个明确结论。
引发这场廷议的钱谦益率先道：
“太祖开国奉天讨元，曾命宋濂等人起草北伐檄文，檄谕齐鲁河洛燕蓟秦晋之人曰：”
“自古帝王临御天下，皆中国居内以制夷狄，夷狄居外以奉中国，未闻以夷狄居中国而制天下也。自宋祚倾移，元以北狄入主中国……”
“可见元朝本为夷狄建立。”
“孔子曰：夷狄之有君，不如诸夏之亡也。”
“太祖解曰：夷狄，禽兽也，故孔子贱之。以为彼国虽有君长，然不知君臣之礼、上下之分，争斗纷然。中国纵亡君长，必不如此。是其有君，曾不如诸夏之亡也。宋儒乃谓中国之人不如夷狄，岂不谬哉！”
“故而元朝君主为夷狄之君，有不如无，不当视为正统，元朝也不是正统朝代。”
这番话态度鲜明，让群臣纷纷侧目。
显然，钱谦益是知道了皇帝的态度，所以发出此言。
作为东林党后起领袖，又主盟大明文坛数十年，钱谦益在朝野的影响力是很大的。
而且很多人还知道，这是一个性子有点软的人，非常容易屈伏皇帝。
他这样的人都坚持元朝不是中国正统王朝，可见皇帝心意。
所以，在钱谦益出言之后，群臣纷纷附和，认为元朝不是正统王朝，元世祖也不是中国之君。
即使有异议的，也无法否认元朝由夷狄建立、更无法推翻孔子的结论。他们只能从天命上，为元朝稍作辩解：
“元朝虽为夷狄建立，却也同样有天命。”
“《谕中原檄》曰：自宋祚倾移，元以北狄入主中国，四海以内，罔不臣服，此岂人力，实乃天授。”
“故而元有天命，当为中国朝代。”
这也是《谕中原檄》的内容，也是大明在对待元朝时，所矛盾的一点。
一部分人认为大明取代的是元朝的天命，元朝自然应该是正统朝代。
另一部分人则严守华夷大防，不承认元朝是中国朝代。
嘉靖年间，因为北虏入寇，朝廷上下仇视蒙古人，不认为元朝是中国正统朝代的观点成为主流，元世祖就是那时候被大明君臣从帝王庙移出去。
一些人以为当今皇帝把元世祖重新请回帝王庙，是承认元朝是中国的正统朝代。故而仍用天命说，阐述大明是取代元朝天命。
这和《谕中原檄》上的矛盾是一脉相承的，大明二百多年来，对元朝的态度一直在承认和不承认之间徘徊。